Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pdrg1P59048 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdrg1P59048 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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