Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dpf3P58269 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dpf3P58269 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms