Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms