Protein–RNA interactions for Protein: P55014

Slc12a1, Solute carrier family 12 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a1P55014 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc12a1P55014 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc12a1P55014 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc12a1P55014 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc12a1P55014 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a1P55014 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a1P55014 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a1P55014 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc12a1P55014 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms