Protein–RNA interactions for Protein: P54830

Ptpn5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn5P54830 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn5P54830 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn5P54830 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn5P54830 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn5P54830 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn5P54830 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn5P54830 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn5P54830 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn5P54830 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn5P54830 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn5P54830 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn5P54830 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn5P54830 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn5P54830 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn5P54830 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn5P54830 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn5P54830 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn5P54830 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn5P54830 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn5P54830 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms