Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cux1P53564 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cux1P53564 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cux1P53564 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cux1P53564 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cux1P53564 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cux1P53564 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cux1P53564 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cux1P53564 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cux1P53564 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cux1P53564 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cux1P53564 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cux1P53564 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cux1P53564 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cux1P53564 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cux1P53564 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cux1P53564 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cux1P53564 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cux1P53564 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cux1P53564 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cux1P53564 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cux1P53564 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cux1P53564 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cux1P53564 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cux1P53564 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cux1P53564 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cux1P53564 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cux1P53564 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cux1P53564 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cux1P53564 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cux1P53564 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cux1P53564 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cux1P53564 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cux1P53564 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cux1P53564 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cux1P53564 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cux1P53564 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cux1P53564 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cux1P53564 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cux1P53564 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cux1P53564 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cux1P53564 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cux1P53564 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cux1P53564 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cux1P53564 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cux1P53564 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cux1P53564 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cux1P53564 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cux1P53564 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cux1P53564 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cux1P53564 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cux1P53564 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cux1P53564 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cux1P53564 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cux1P53564 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cux1P53564 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms