Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClgnP52194 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClgnP52194 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClgnP52194 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClgnP52194 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ClgnP52194 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClgnP52194 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClgnP52194 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ClgnP52194 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClgnP52194 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClgnP52194 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClgnP52194 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ClgnP52194 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms