Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Apobec1P51908 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms