Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TspoP50637 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TspoP50637 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TspoP50637 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TspoP50637 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TspoP50637 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TspoP50637 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TspoP50637 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TspoP50637 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TspoP50637 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TspoP50637 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TspoP50637 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TspoP50637 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TspoP50637 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TspoP50637 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TspoP50637 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TspoP50637 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TspoP50637 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TspoP50637 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TspoP50637 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TspoP50637 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TspoP50637 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TspoP50637 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TspoP50637 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TspoP50637 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TspoP50637 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TspoP50637 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TspoP50637 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TspoP50637 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TspoP50637 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TspoP50637 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TspoP50637 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TspoP50637 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TspoP50637 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TspoP50637 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TspoP50637 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TspoP50637 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TspoP50637 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TspoP50637 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TspoP50637 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TspoP50637 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TspoP50637 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TspoP50637 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TspoP50637 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TspoP50637 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TspoP50637 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TspoP50637 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TspoP50637 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TspoP50637 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TspoP50637 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TspoP50637 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TspoP50637 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TspoP50637 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TspoP50637 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TspoP50637 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TspoP50637 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TspoP50637 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TspoP50637 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TspoP50637 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TspoP50637 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TspoP50637 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TspoP50637 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TspoP50637 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TspoP50637 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TspoP50637 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TspoP50637 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TspoP50637 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TspoP50637 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TspoP50637 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TspoP50637 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TspoP50637 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TspoP50637 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TspoP50637 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TspoP50637 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TspoP50637 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TspoP50637 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TspoP50637 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TspoP50637 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TspoP50637 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TspoP50637 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TspoP50637 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TspoP50637 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TspoP50637 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TspoP50637 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TspoP50637 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TspoP50637 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TspoP50637 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TspoP50637 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TspoP50637 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TspoP50637 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TspoP50637 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TspoP50637 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TspoP50637 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TspoP50637 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TspoP50637 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TspoP50637 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TspoP50637 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TspoP50637 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TspoP50637 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TspoP50637 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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