Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SftpdP50404 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SftpdP50404 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SftpdP50404 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SftpdP50404 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SftpdP50404 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SftpdP50404 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SftpdP50404 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms