Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Tmod1P49813 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
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Tmod1P49813 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Tmod1P49813 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmod1P49813 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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