Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TgfaP48030 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TgfaP48030 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TgfaP48030 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TgfaP48030 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TgfaP48030 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TgfaP48030 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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