Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gli1P47806 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gli1P47806 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gli1P47806 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gli1P47806 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gli1P47806 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gli1P47806 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gli1P47806 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli1P47806 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli1P47806 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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