Protein–RNA interactions for Protein: P47774

Ccr7, C-C chemokine receptor type 7, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr7P47774 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccr7P47774 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr7P47774 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr7P47774 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr7P47774 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr7P47774 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr7P47774 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr7P47774 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr7P47774 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr7P47774 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr7P47774 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr7P47774 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccr7P47774 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccr7P47774 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccr7P47774 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr7P47774 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr7P47774 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr7P47774 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr7P47774 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr7P47774 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr7P47774 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr7P47774 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr7P47774 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccr7P47774 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr7P47774 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr7P47774 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr7P47774 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr7P47774 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr7P47774 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr7P47774 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr7P47774 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr7P47774 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr7P47774 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr7P47774 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms