Protein–RNA interactions for Protein: P47708

Rph3a, Rabphilin-3A, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3aP47708 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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