Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf1P46099 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf1P46099 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf1P46099 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf1P46099 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf1P46099 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf1P46099 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf1P46099 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf1P46099 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf1P46099 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf1P46099 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf1P46099 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf1P46099 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms