Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf4P43488 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf4P43488 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf4P43488 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf4P43488 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf4P43488 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf4P43488 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfsf4P43488 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfsf4P43488 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfsf4P43488 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfsf4P43488 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfsf4P43488 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfsf4P43488 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfsf4P43488 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfsf4P43488 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfsf4P43488 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfsf4P43488 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfsf4P43488 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf4P43488 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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