Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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PtgfrP43117 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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PtgfrP43117 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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PtgfrP43117 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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PtgfrP43117 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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PtgfrP43117 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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PtgfrP43117 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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PtgfrP43117 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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PtgfrP43117 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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PtgfrP43117 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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PtgfrP43117 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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PtgfrP43117 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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PtgfrP43117 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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PtgfrP43117 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PtgfrP43117 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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