Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NodalP43021 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NodalP43021 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NodalP43021 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NodalP43021 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NodalP43021 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NodalP43021 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NodalP43021 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NodalP43021 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NodalP43021 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NodalP43021 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NodalP43021 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NodalP43021 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NodalP43021 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NodalP43021 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NodalP43021 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NodalP43021 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NodalP43021 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NodalP43021 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NodalP43021 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NodalP43021 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NodalP43021 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NodalP43021 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NodalP43021 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NodalP43021 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NodalP43021 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NodalP43021 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NodalP43021 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NodalP43021 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NodalP43021 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NodalP43021 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NodalP43021 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NodalP43021 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NodalP43021 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NodalP43021 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NodalP43021 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NodalP43021 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NodalP43021 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NodalP43021 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NodalP43021 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NodalP43021 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NodalP43021 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NodalP43021 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NodalP43021 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NodalP43021 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NodalP43021 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NodalP43021 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NodalP43021 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NodalP43021 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NodalP43021 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NodalP43021 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NodalP43021 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NodalP43021 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NodalP43021 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NodalP43021 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NodalP43021 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NodalP43021 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NodalP43021 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NodalP43021 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NodalP43021 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NodalP43021 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NodalP43021 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NodalP43021 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NodalP43021 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NodalP43021 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NodalP43021 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NodalP43021 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NodalP43021 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NodalP43021 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NodalP43021 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NodalP43021 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NodalP43021 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NodalP43021 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NodalP43021 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NodalP43021 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NodalP43021 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NodalP43021 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NodalP43021 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NodalP43021 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NodalP43021 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NodalP43021 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NodalP43021 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NodalP43021 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NodalP43021 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NodalP43021 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NodalP43021 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NodalP43021 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NodalP43021 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NodalP43021 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NodalP43021 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NodalP43021 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NodalP43021 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NodalP43021 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NodalP43021 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NodalP43021 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NodalP43021 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NodalP43021 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NodalP43021 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NodalP43021 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NodalP43021 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms