Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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