Protein–RNA interactions for Protein: P41241

Csk, Tyrosine-protein kinase CSK, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CskP41241 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CskP41241 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CskP41241 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CskP41241 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CskP41241 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CskP41241 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CskP41241 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CskP41241 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CskP41241 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CskP41241 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CskP41241 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CskP41241 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CskP41241 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CskP41241 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CskP41241 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CskP41241 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CskP41241 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CskP41241 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CskP41241 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CskP41241 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CskP41241 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CskP41241 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CskP41241 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CskP41241 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CskP41241 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CskP41241 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CskP41241 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CskP41241 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CskP41241 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CskP41241 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CskP41241 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CskP41241 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CskP41241 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CskP41241 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CskP41241 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CskP41241 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CskP41241 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CskP41241 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CskP41241 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CskP41241 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CskP41241 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CskP41241 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CskP41241 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CskP41241 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CskP41241 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CskP41241 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CskP41241 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CskP41241 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CskP41241 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CskP41241 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CskP41241 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CskP41241 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CskP41241 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CskP41241 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CskP41241 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CskP41241 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CskP41241 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CskP41241 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CskP41241 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CskP41241 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CskP41241 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CskP41241 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CskP41241 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CskP41241 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CskP41241 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CskP41241 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CskP41241 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CskP41241 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CskP41241 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CskP41241 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CskP41241 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CskP41241 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CskP41241 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CskP41241 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CskP41241 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CskP41241 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CskP41241 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CskP41241 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CskP41241 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CskP41241 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CskP41241 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CskP41241 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CskP41241 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CskP41241 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CskP41241 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CskP41241 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CskP41241 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CskP41241 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CskP41241 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CskP41241 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CskP41241 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CskP41241 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CskP41241 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CskP41241 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CskP41241 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CskP41241 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CskP41241 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CskP41241 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CskP41241 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CskP41241 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms