Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbP41155 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbP41155 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LtbP41155 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtbP41155 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtbP41155 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtbP41155 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtbP41155 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtbP41155 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtbP41155 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtbP41155 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtbP41155 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtbP41155 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtbP41155 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LtbP41155 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LtbP41155 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LtbP41155 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtbP41155 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtbP41155 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtbP41155 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LtbP41155 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtbP41155 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtbP41155 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtbP41155 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtbP41155 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtbP41155 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtbP41155 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtbP41155 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtbP41155 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtbP41155 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtbP41155 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtbP41155 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtbP41155 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtbP41155 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtbP41155 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtbP41155 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtbP41155 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LtbP41155 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LtbP41155 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LtbP41155 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LtbP41155 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LtbP41155 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LtbP41155 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LtbP41155 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LtbP41155 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LtbP41155 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LtbP41155 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LtbP41155 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LtbP41155 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LtbP41155 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LtbP41155 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LtbP41155 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LtbP41155 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LtbP41155 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LtbP41155 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LtbP41155 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LtbP41155 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LtbP41155 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LtbP41155 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LtbP41155 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LtbP41155 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LtbP41155 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LtbP41155 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LtbP41155 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LtbP41155 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LtbP41155 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LtbP41155 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LtbP41155 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LtbP41155 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LtbP41155 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LtbP41155 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LtbP41155 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LtbP41155 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LtbP41155 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LtbP41155 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LtbP41155 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LtbP41155 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LtbP41155 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LtbP41155 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LtbP41155 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LtbP41155 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LtbP41155 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LtbP41155 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LtbP41155 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LtbP41155 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LtbP41155 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LtbP41155 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LtbP41155 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LtbP41155 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LtbP41155 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LtbP41155 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LtbP41155 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LtbP41155 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LtbP41155 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LtbP41155 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LtbP41155 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
LtbP41155 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LtbP41155 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LtbP41155 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LtbP41155 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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