Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf2P39429 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf2P39429 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf2P39429 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf2P39429 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf2P39429 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf2P39429 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf2P39429 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf2P39429 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms