Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Traf1P39428 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Traf1P39428 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Traf1P39428 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Traf1P39428 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Traf1P39428 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf1P39428 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf1P39428 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf1P39428 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf1P39428 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf1P39428 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf1P39428 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf1P39428 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf1P39428 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf1P39428 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf1P39428 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf1P39428 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf1P39428 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf1P39428 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf1P39428 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf1P39428 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf1P39428 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf1P39428 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf1P39428 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf1P39428 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf1P39428 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf1P39428 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf1P39428 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf1P39428 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf1P39428 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Traf1P39428 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Traf1P39428 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf1P39428 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf1P39428 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf1P39428 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Traf1P39428 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms