Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn1P35821 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms