Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin1P35438 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin1P35438 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin1P35438 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin1P35438 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin1P35438 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms