Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nedd1P33215 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms