Protein–RNA interactions for Protein: P32211

Chrm4, Muscarinic acetylcholine receptor M4, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm4P32211 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chrm4P32211 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chrm4P32211 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms