Protein–RNA interactions for Protein: P31316

Gsx2, GS homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx2P31316 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gsx2P31316 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms