Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnnd1P30999 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms