Protein–RNA interactions for Protein: P30873

Sstr1, Somatostatin receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sstr1P30873 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sstr1P30873 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms