Protein–RNA interactions for Protein: P29594

Casp2, Caspase-2, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp2P29594 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp2P29594 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp2P29594 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp2P29594 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp2P29594 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp2P29594 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp2P29594 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casp2P29594 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casp2P29594 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms