Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkcdP28867 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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