Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprmP28828 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprmP28828 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprmP28828 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprmP28828 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprmP28828 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprmP28828 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprmP28828 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprmP28828 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprmP28828 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprmP28828 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprmP28828 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprmP28828 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
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