Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxrgP28705 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxrgP28705 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxrgP28705 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxrgP28705 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxrgP28705 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RxrgP28705 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms