Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxraP28700 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxraP28700 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxraP28700 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxraP28700 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxraP28700 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxraP28700 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxraP28700 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxraP28700 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxraP28700 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxraP28700 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxraP28700 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxraP28700 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxraP28700 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxraP28700 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxraP28700 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxraP28700 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxraP28700 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxraP28700 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxraP28700 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxraP28700 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxraP28700 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxraP28700 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxraP28700 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxraP28700 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxraP28700 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxraP28700 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxraP28700 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxraP28700 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxraP28700 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxraP28700 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RxraP28700 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxraP28700 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxraP28700 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxraP28700 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxraP28700 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxraP28700 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxraP28700 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxraP28700 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxraP28700 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxraP28700 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxraP28700 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxraP28700 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxraP28700 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxraP28700 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxraP28700 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxraP28700 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxraP28700 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxraP28700 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxraP28700 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxraP28700 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxraP28700 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RxraP28700 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RxraP28700 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RxraP28700 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RxraP28700 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RxraP28700 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RxraP28700 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RxraP28700 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RxraP28700 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RxraP28700 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RxraP28700 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RxraP28700 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RxraP28700 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RxraP28700 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RxraP28700 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RxraP28700 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RxraP28700 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RxraP28700 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RxraP28700 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RxraP28700 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RxraP28700 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RxraP28700 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RxraP28700 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RxraP28700 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RxraP28700 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RxraP28700 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RxraP28700 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RxraP28700 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RxraP28700 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RxraP28700 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RxraP28700 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RxraP28700 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RxraP28700 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RxraP28700 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RxraP28700 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RxraP28700 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RxraP28700 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RxraP28700 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RxraP28700 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RxraP28700 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RxraP28700 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RxraP28700 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RxraP28700 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RxraP28700 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RxraP28700 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RxraP28700 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RxraP28700 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RxraP28700 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RxraP28700 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms