Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gjb3P28231 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb3P28231 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms