Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpl3P27659 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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