Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctnna1P26231 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna1P26231 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms