Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd247P24161 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd247P24161 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cd247P24161 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd247P24161 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd247P24161 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd247P24161 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd247P24161 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd247P24161 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms