Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Hoxd12P23812 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Hoxd12P23812 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Hoxd12P23812 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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Hoxd12P23812 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms