Protein–RNA interactions for Protein: P23611

Irf8, Interferon regulatory factor 8, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf8P23611 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf8P23611 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf8P23611 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf8P23611 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf8P23611 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf8P23611 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf8P23611 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf8P23611 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf8P23611 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf8P23611 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf8P23611 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms