Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ggta1P23336 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ggta1P23336 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms