Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a2P20490 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms