Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P20040 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P20040 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P20040 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P20040 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P20040 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P20040 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P20040 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P20040 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P20040 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P20040 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P20040 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
P20040 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
P20040 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P20040 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P20040 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P20040 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P20040 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P20040 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P20040 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P20040 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P20040 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P20040 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P20040 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P20040 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P20040 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P20040 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P20040 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P20040 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P20040 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P20040 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P20040 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P20040 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P20040 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P20040 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P20040 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P20040 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P20040 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P20040 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P20040 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P20040 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P20040 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
P20040 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
P20040 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P20040 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P20040 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P20040 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P20040 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P20040 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P20040 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P20040 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P20040 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P20040 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P20040 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P20040 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P20040 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P20040 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P20040 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P20040 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P20040 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P20040 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P20040 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P20040 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P20040 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
P20040 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P20040 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P20040 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P20040 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P20040 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P20040 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P20040 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P20040 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P20040 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P20040 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P20040 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P20040 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P20040 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P20040 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P20040 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P20040 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P20040 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P20040 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P20040 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P20040 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P20040 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P20040 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P20040 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P20040 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P20040 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P20040 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P20040 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P20040 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P20040 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P20040 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P20040 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P20040 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P20040 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P20040 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P20040 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P20040 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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