Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PdgfaP20033 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms