Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NelfeP19426 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NelfeP19426 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NelfeP19426 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NelfeP19426 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NelfeP19426 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NelfeP19426 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NelfeP19426 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NelfeP19426 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NelfeP19426 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms