Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms