Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RargP18911 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RargP18911 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RargP18911 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RargP18911 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RargP18911 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RargP18911 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RargP18911 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RargP18911 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RargP18911 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RargP18911 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RargP18911 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RargP18911 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RargP18911 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RargP18911 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RargP18911 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RargP18911 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RargP18911 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RargP18911 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RargP18911 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RargP18911 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RargP18911 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RargP18911 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RargP18911 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RargP18911 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RargP18911 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RargP18911 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RargP18911 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RargP18911 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RargP18911 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RargP18911 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RargP18911 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RargP18911 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RargP18911 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RargP18911 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RargP18911 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RargP18911 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RargP18911 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RargP18911 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RargP18911 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RargP18911 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RargP18911 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RargP18911 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RargP18911 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RargP18911 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RargP18911 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RargP18911 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RargP18911 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RargP18911 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RargP18911 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RargP18911 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RargP18911 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RargP18911 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RargP18911 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RargP18911 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RargP18911 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RargP18911 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RargP18911 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RargP18911 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RargP18911 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RargP18911 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RargP18911 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RargP18911 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RargP18911 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RargP18911 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RargP18911 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RargP18911 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RargP18911 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RargP18911 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RargP18911 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RargP18911 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RargP18911 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RargP18911 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RargP18911 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RargP18911 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RargP18911 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RargP18911 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RargP18911 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RargP18911 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RargP18911 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RargP18911 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RargP18911 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RargP18911 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RargP18911 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RargP18911 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RargP18911 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RargP18911 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RargP18911 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RargP18911 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RargP18911 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RargP18911 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RargP18911 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RargP18911 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RargP18911 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RargP18911 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RargP18911 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RargP18911 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RargP18911 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RargP18911 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RargP18911 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms