Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata1P17679 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata1P17679 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata1P17679 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata1P17679 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata1P17679 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata1P17679 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gata1P17679 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Gata1P17679 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gata1P17679 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gata1P17679 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms